1894年甲午战争清廷失败，翌年割台湾给日本，林维源及其子叔臧不愿当亡国奴，迁到鼓浪屿居住。其后，叔臧建了这座花园。

　　菽庄依海建园，海藏园中，傍山为洞，垒石补山，与远处山光水色互为衬托，浑为一体。所造楼台亭榭不一其形，迦桥低栏，形若游龙。园内看海，波浪拍岸，依栏远眺，极尽山海之致，复有岩洞之幽，鲜花满径，绿树成行，为难得之胜景。

　　花园建造分藏海园、补山园两部分。主要是以园藏海，以园饰海、以海拓园、以石补山、以洞藏天。

　　进园，便有横墙一堵，挡住游人视线，把海藏入园内。

　　藏海园有五景：即眉寿堂、壬秋阁、真率亭、四十四桥、招凉亭；补山园也有五景，即顽石山房、十二洞天、亦爱吾庐、听潮楼、小兰亭。以后又陆续建小板桥，渡月亭、千波亭、熙春亭、茅亭、 扇亭等。

　　"眉寿堂"位于入园庭院右侧，表示祝愿长寿的意思。又名"谈瀛轩"，因台湾古时称瀛州，此乃表示怀念台湾的意思。眉寿堂临海两边有曲堤，每逢大潮，坐在堤上俯身可以掬水，倘在月夜，又可领略"掬水月在手"、"满目飞明镜"的意境。

　　壬秋阁，建于农历岁次壬戌之秋而得名，落成之日，正逢久雨初晴，江山如洗，主人趁此良辰邀客吟诗，自己也吟有："横江鹤去笛声在，未信消沉八百年"之句。壬秋阁水陆各半，东西两拱门，一背陆一朝水，在此可观山赏海，山岚流云，帆影鸥鸟，尽收眼帘。

　　真率亭，形状似菱，背山临水，仁者乐山，智者乐水，在此见仁见智，各抒已见，可达到"真诚坦率，胸无芥事"的境界。

　　四十四桥，乃全国主景，因主人建桥时四十四岁而得名。此桥下有闸门，把海水引入园内，构成了大海、外池、内池三处，把大海藏进去。由于桥身迂回曲折、凌波卧海，宛如游龙。桥上有观鱼台，渡月亭，千波亭，渡月亭有楹联："长桥支海三千丈，明月浮空十二栏"。在月夜，坐在亭里，看皓月当空，静影沉璧，令人浮想联翩，月下涛声，轻如细语，仿佛与人谈心。明月之夜，游此最佳。

　　千波亭，造形幽雅精巧，游人在此观潮、听涛、踯躅、盘桓，均能各尽其妙。

　　招凉亭，面对大海，凉风习习，且亭子造型如折扇，更有招凉之意。

　　补山园，隐含山河破碎，亟待修补之意。"十二洞天"是人工造出来的连环洞，像猴子洞，因客人进洞摸不出路来，又叫迷魂洞。十二洞天，即十二洞室，以地支的子、丑、寅、……戊、亥为名，洞室大小、形状各异，小径错落、上下盘旋，曲折迷离。

　　亦爱吾庐，乃林家居住的院子，昔日用竹篱笆围起来，并种菊花，主人在欣赏"竹禽茅舍自甘心"之余，对家居情景，颇为自得，故名"亦爱吾庐"。

　　顽石山房，是主人读书之地，他自比"顽石"希望通过攻读，能够聪明颖悟，故称"顽石山房"。

　　菽庄花园总面积20328平方米，其中水域3352平方米，建筑物2451平方米。以有限面积，造无限空间，以小见大，耐人寻味。本来这个庭院以静为主，静中生趣，但眼前波涛拍岸，浪花飞溅。涛声回响，形成静中有动，动中有静，动静对比，相得益彰，珠联璧合，妙趣横生。

　　从妙处说，是"藏"、"借"、"巧"三个字。"藏"就是把海藏起来，进门左拐后，才能见到万顷碧波的大海；四十四桥把海水引入园内，变成大海、外池、内池，使海水不再扬波，这就是"藏"字做工夫。

　　"借"，就是借景、借声、借意、借影。化他物为已物，纳外景为内景，借日光岩为仰景，南太武山为远景，借大海做铺垫，借楼阁做近景，构成了一幅美丽的画卷。

　　"巧"，四十四桥凌波卧海，按不同地形变化，依山垒石建亭，围池砌阶联以曲桥，宛如游龙。使小巧玲珑的花园，扩大数倍，且园内亭阁无一雷同，此乃巧字做工夫。